財政部高雄市國稅局表示，扣繳義務人依法辦理綜合所得稅各類所得扣繳稅款時，偶爾會有多扣或少扣之情事發生，扣繳義務人經常不知如何處理是好。
國稅局表示，扣繳稅款如有多扣情事，扣繳義務人應該把多扣之稅款退還給納稅義務人，並且可以向國稅局申請退還或就其同年度應扣繳稅款內留抵；年度結束時，如尚有未抵繳完之稅款，可以檢附扣繳繳款書正本及相關證明文件，向國稅局申請退稅。惟納稅義務人如已將該筆多扣繳之稅款，合併於取得年度之綜合所得稅申報者，扣繳義務人則不得再申請退還稅款。
至於扣繳義務人短扣繳稅款部分，該局表示應由扣繳義務人補繳，但扣繳義務人得向納稅義務人追償之。