財政部臺北市國稅局表示，近來有營利事業詢問，因員工執行職務受傷就醫，由營利事業給付國內醫院或診所之醫藥費，是否應填報該醫院或診所之各類所得扣繳暨免扣繳憑單？
該局說明，營利事業因所屬員工執行職務受傷而就醫，由營利事業給付國內醫療院所的醫藥費用，應填報扣免繳憑單規定如下：（一）给付國內公立醫院之醫療費用，給付時免予扣繳所得稅款，亦免填報免扣繳憑單。（二）給付國內私人診所之醫藥費，依各類所得扣繳率標準第2條規定，應按給付額扣取10﹪之扣繳稅款，並填報執行業務所得扣繳憑單。（三）給付財團法人醫院之醫療費用，免予扣繳所得稅，但應依所得稅法第89條第3項規定，填報其他所得免扣繳憑單。
該局指出，營利事業因員工執行職務受傷而由營利事業給付的醫藥費，非屬醫藥補助性質，免予計入該員工之薪資所得，如該醫藥費係由員工就醫時先行墊付後再檢據向營利事業支領者，則免對醫療院所辦理扣繳亦免填報扣繳憑單。