財政部臺北市國稅局表示，營利事業負責人即扣繳義務人，如被查獲有漏扣或短扣繳稅款時，應於限期內補繳應扣繳稅款，並向所在地國稅局分局或稽徵所補辦理扣繳憑單申報，如逾期未補辦申報手續，負責人仍應受罰。 該局說明，通常扣繳義務人於給付各類所得時即應扣繳稅款，並依規定於每月10日前將上一個月內所扣稅款向國庫繳清，並於每年1月底前，將上一年度給付之金額、所得人及扣繳稅款等資料，彙集開立扣繳憑單，向所在地國稅局分局或稽徵所辦理扣繳申報。若是有短扣或漏扣繳稅款經國稅局查獲情形，將通知限期補繳應扣之稅款及補報扣繳憑單。如僅補繳應扣繳之稅款，而未依限期補報扣繳憑單者，依規定仍應予處罰。 該局指出，扣繳義務人接獲通知後，應於限期內補繳短漏扣繳稅款及補報扣繳憑單。惟部分扣繳義務人只注意於限期內向國庫繳清短漏扣的稅款，卻忘了應在限期內補申報扣繳憑單，經國稅局依所得稅法第114條第1款後段暨稅務違章案件減免處罰標準第6條第1項第2款規定，按短漏扣繳稅額處1.5倍的罰鍰。該局籲請扣繳義務人注意，短、漏扣繳稅款補繳完畢之後，務必記得於限期內補報扣繳憑單，以免遭受處罰。