財政部臺北市國稅局表示，納稅義務人所有房屋遭法院拍賣，拍賣和自行出售同為所有權移轉，辦理年度綜合所得稅結算申報時均應列入財產交易所得申報，如果被拍賣的房屋價格比原始購入成本低的時候，應檢附買賣契約（私契）、資金流程及貸款資料等證明文件，計算財產交易所得或損失。
該局指出，依所得稅法第14條規定，財產交易所得是以財產交易時之成交價額，減除原始取得之成本，及因取得、改良及移轉該項資產而支付之一切費用後之餘額為所得額。故個人房屋遭法院拍賣，如能提出交易時之成交價額及成本費用之證明文件，可覈計算其財產交易所得或損失；如未能提出證明文件，稽徵機關將依財政部訂頒之標準核定財產交易所得。舉例說明，甲君95年度綜合所得稅結算申報未申報當年度被拍賣房屋之財產交易所得，該局依財政部規定標準核定財產交易所得20餘萬元，補稅9萬多元，甲君不服提起復查，主張房屋被拍賣並沒有所得，惟未能提示買入房屋契約（私契）、資金流程及貸款資料等供核，遭該局駁回。
該局呼籲，民眾買賣房屋務必保存原始資料，包括買賣契約（私契）、資金流程及貸款資料等，供作申報所得稅之證明文件，以維自身權益。