營業人銷售貨物與自由貿易港區事業供營運之貨物，自97年6月1日起，如經通關程序且出口報單類別為F4、D5、B9及統計方式為97、1A、9U者，其營業稅得申報適用零稅率並免檢附證明文件。 
 南區國稅局表示，依自由貿易港區設置管理條例第26條第1項規定，課稅區或保稅區之營業人（賣方）銷售與自由貿易港區事業供營運之貨物，可適用零稅率。所以營業人銷售與自由貿易港區事業供營運之貨物，其營業稅率申報適用零稅率者，應將海關核發視同出口證明文件或其所開立之統一發票扣抵聯，交由自由貿易港區事業（買方）依實際購買用途於空白處或背面簽署「本證明文件（或發票）所列貨物確係本事業購買符合自由貿易港區設置管理條例第26條第1項規定供營運之貨物無訛」字樣，並加蓋統一發票專用章，作為適用零稅率之證明文件。
 基於簡政便民，財政部於97/05/22發布函示規定，營業人銷售貨物與自由貿易港區事業供營運之貨物，如經通關程序且出口報單類別為F4、D5、B9及統計方式為97、1A、9U者，自97年6月1日起，其營業稅得申報適用零稅率並免檢附證明文件，惟營業人申報適用零稅率銷售額清單「外銷方式」欄填代號「4」（與適用營業稅法第7條第4款者類同）及於營業人銷售額與稅額申報書填報「零稅率銷售額」欄「經海關出口免附證明文件者」填報銷售額。
 該局呼籲，營業人銷售貨物與自由貿易港區事業供營運之貨物，凡符合上揭通關方式者，自6月1日起均免檢附證明文件申報適用零稅率，惟稽徵機關如有查核之必要時，仍須提供相關文件供核。