財政部臺北市國稅局表示，營業人因員工至外地出差接洽業務取得之高鐵車票，得列為進項憑證，於申報營業稅時扣抵銷項稅額。 
該局說明，依加值型及非加值型營業稅法第4章第1節計算稅額營業人取得之進項憑證，除依同法第19條第1項規定不得扣抵者外，均可扣抵銷項稅額。員工出差旅費可檢具運輸事業開立之火〈汽〉車、船舶、飛機等收據或票根之影本申報扣抵銷項稅額。故營業人如因業務需要，派遣員工至外地出差搭乘高鐵，其車票亦可比照辦理，作為進項憑證申報扣抵銷項稅額。 
該局指出，因車票訂價內含營業稅額，營業人應依下列公式計算進項稅額：【車票金額÷〈1+5%〉x5%=進項稅額】，尾數不滿1元者，按四捨五入計算得扣抵進項稅額。例如：員工出差搭乘高鐵，自臺北至臺中普通車廂票價700元，營業人在申報當期營業稅時，可於載有稅額之其他憑證中加計進項金額667元，稅額33元【700 ÷〈1+5%〉x5%】扣抵銷項稅額。 
該局呼籲，營業人如未將前項進項憑證於當期申報者，得延至次期申報扣抵，次期仍未申報者，應於申報扣抵當期敘明理由，並應受5年期間之限制。