財政部臺北市國稅局表示，納稅義務人如有因適用法令錯誤或計算錯誤致溢繳之稅款，得自繳納之日起5年內提出具體證明，申請退還，逾期未申請者，即不得再行申請。
 該局指出，按所得稅法第71條規定，納稅義務人有據實按期限辦理所得稅結算申報的義務，某公司自國外進口貨物，未依關稅法第29條規定將支付國外公司之佣金支出列入貨品成本申報關稅，而於辦理營利事業所得稅結算申報時，將該項佣金支出列為存貨成本之加項，嗣後被財政部關稅總局查獲，並據以補繳關稅及商港建設費，該公司於完納上開關稅及商港建設費後，向該局申請增列進貨成本，並申請退還原申報溢繳之營利事業所得稅結算申報應納稅款。因未於繳納該年度營利事業所得稅結算申報應納稅款之日起5年內提出申請，遭該局否准，該公司雖依序提起訴願及行政訴訟，仍遭駁回。