財政部臺灣省北區國稅局表示：「行政罰之裁處權，因3年期間之經過而消滅。」雖為行政罰法第27條第1項之規定，惟同法第1條亦規定：「違反行政法上義務而受罰鍰、沒入或其他種類行政罰之處罰時，適用本法。但其他法律有特別規定者，從其規定。」而稅捐稽徵法規定，在核課期間內，經另發現應徵之稅捐者，仍應依法補徵或並予處罰，故稽徵機關依稅捐稽徵法規定裁處罰鍰不受行政罰法3年之限制。 
該局進一步表示：按「稅捐之核課期間，依左列規定：一、依法應由納稅義務人申報繳納之稅捐，已在規定期間內申報，且無故意以詐欺或其他不正當方法逃漏稅捐者，其核課期間為五年。……三、未於規定期間內申報，或故意以詐欺或其他不正當方法逃漏稅捐者，其核課期間為七年。在前項核課期間內，經另發現應徵之稅捐者，仍應依法補徵或並予處罰；在核課期間內未經發現者，以後不得再補稅處罰。」為稅捐稽徵法第21條所規定。 

該局表示轄內○君係證券交易稅條例第4條所稱之證券交易稅代徵人，於91年間向A公司購買B公司股票10,000股，經該局臺北縣分局查獲成交價格新臺幣（下同）650,000元，應代徵證券交易稅1,950元，○君僅代徵1,140元，短代徵稅款810元，乃責令補繳短徵稅額810元，並經本局處罰鍰12,100元。○君不服，主張依行政罰法第27條第1項規定，行政罰之裁處權，因3年期間之經過而消滅，本件稽徵機關已逾3年裁處期間，該項罰鍰應予撤銷云云，經該局復查決定以行政罰法第1條明定規定行政罰之處罰，其他法律有特別規定者，從其規定。……該分局在依稅捐稽徵法規定5年核課期間內裁處罰鍰，並無違誤，而予以駁回。 

該局提醒納稅義務人，稅捐稽徵法相對行政罰法而言是特別法，基於特別法優於普通法之法理，依稅捐稽徵法規定裁處罰鍰，不受行政罰法3年之限制。是請納稅義務人釐清此觀念，以免誤解法令徒增爭訟。