公司組織之營利事業於結算年度中有盈餘，且 假設 該公司當年度可適用以往年度虧損扣除與廢止前促進產業升級條例（以下簡稱廢止前促產條例）及產業創新條例（以下簡稱產創條例）等相關法規中有關投資抵減之規定 ，財政部為維護業者權益， 已准許業者自行選用 ，惟公司究應如何選用，須先瞭解投資抵減、所得基本稅額及虧損扣除之規定，方能獲得最大的節稅利益：

• 投資抵減：

1. 公司若有廢止前促產條例之投資抵減，其投資抵減之稅額自當年度起 5 年內抵減各年度應納營利事業所得稅。其每一年度得抵減總額，以不超過該公司當年度應納營利事業所得稅額 50% 為限。但最後年度抵減金額，不在此限。 投資抵減限額另有規定者 ，從其規定。

2. 公司若有產創條例之研究發展支出投資抵減，僅能抵減當年度應納營利事業所得稅，且其投資抵減稅額上限為當年度應納營利事業所得稅 30% 。

3. 公司依廢止前促產條例第 6 條規定以 98 年度及以前年度營利事業所得稅結算申報經稅捐稽徵機關核定尚未抵減之該條第 1 項及第 2 項規定支出投資抵減稅額及依產創條例第 10 條規定之研究發展支出投資抵減稅額，抵減 99 年度及以後年度之營利事業所得稅額時，應先依產創條例第 10 條規定抵減當年度研究發展支出投資抵減稅額，如仍有應納稅額尚未抵減，再依廢止前促產條例第 6 條規定抵減前開經稅捐稽徵機關核定尚未抵減之投資抵減稅額。前開抵減總金額以當年度應納營利事業所得稅額之 50% 為限，但廢止前促產條例第 6 條規定之最後年度抵減稅額，不在此限。

• 所得基本稅額：

1. 營利事業一般所得稅額之計算：為營利事業當年度依所得稅法規定計算之應納稅額，減除依其他法律規定之投資抵減稅額後之餘額。

2. 營利事業之基本所得額之計算：為依所得稅法規定計算之課稅所得額，加計應計入各款 免稅 所得額後之合計數。基本稅額，為基本所得額扣除新臺幣 2,000,000 元後，再乘上 10% 之稅率計算之金額。

3. 營利事業依所得基本稅額條例規定計算之一般所得稅額低於基本稅額者，其應繳納之所得稅，除按所得稅法及其他相關法律計算認定外，應另就基本稅額與一般所得稅額之差額認定之。且該差額，不得以其他法律規定之投資抵減稅額減除之。

• 虧損扣除為前 10 年度內之各期虧損： 98 年 1 月 21 日 總統華總一義字第 09800014571 號令修正公布所得稅法第 39 條條文，將虧損扣除為前 5 年度內之各期虧損修改為前 10 年度內之各期虧損，修正施行前經稽徵機關核定之以前年度虧損，尚未依法扣除完畢者，可適用修正後之規定。亦即公司如截至 97 年底有尚未扣除之 92 年度以後之虧損，虧損扣除年限為 10 年。

茲以實例來說明，供業者參考：

設ＸＸ公司 92 年度 至 100 年度營利事業所得稅結算申報均委託會計師簽證，於 100 年度有符合產業創新條例之研究發展支出為 800,000 元，抵減率為 15% ，可抵減稅額為 120,000 元（ 800,000 × 15% ）， 96 年度 至 98 年度經核定有廢止前促產條例投資抵減尚未抵減之餘額各為 300,000 元，共計 900,000 元， 92 年度 至 99 年度核定所得額各為虧損 1,000,000 元，共計本年度可扣抵之虧損數為 8,000,000 元。因以往年度核定之課稅所得額皆為虧損，故以往年度投資抵減金額均未使用， 100 年度經核定所得額為 5,000,000 元，該公司可選擇下面方式申報：

1. 選擇適用投資抵減，除已屆最後抵減年限之投資抵減全數抵減外，產創條例之投資抵減加上廢止前促產條例投資抵減餘額抵至應納稅額 50% ：

（ 1 ）因產創條例之投資抵減僅能抵 減 當年度 應納稅額 ，故公司先抵產創條例之投資抵減 120,000 元（未超過應納稅額 30% ），又因 96 年度之廢止前促產條例投資抵減於本年度為最後一年，公司再抵 96 年度之投資抵減 300,000 元。

（ 2 ）若公司本年度未將以前年度核定虧損自全年所得額項下扣除，則本年度應納稅額為 850,000 元（ 5,000,000 元× 17% ），除 96 年度之廢止前促產條例投資抵減外（最後一年，不受應納稅額 50% 之限制），產創條例之投資抵減加上已核定尚未抵減之廢止前促產條例投資抵減餘額可抵至應納稅額 50% ，故公司尚可再抵 305,000 元（ 850,000 元× 50% － 120,000 元），則本年度應自繳金額為 125,000 元（ 850,000 元－ 120,000 元－ 300,000 元－ 305,0000 元）。

（ 3 ）該公司依所得基本稅額條例之規定，一般所得稅額為 125,000 元（ 850,000 元－ 120,000 元－ 300,000 元－ 305,000 元）， 基本稅額 為 300,000 元【（ 5,000,000 元－ 2,000,000 元）× 10% 】，亦即公司至少本年度自繳稅款最低為 300,000 元，故公司尚應繳納一般所得稅額與基本稅額 之差額 175,000 元（ 300,000 元－ 125,000 元）

（ 4 ）總計公司本年度自繳稅款為 300,000 元。而已核定可供以後年度使用之尚未抵減之廢止前促產條例投資抵減餘額為 295,000 元（ 900,000 元－ 300,000 元－ 305,000 元）。以後年度可使用之虧損扣除數為 8,000,000 元。

2. 選擇適用投資抵減，除已屆最後抵減年限之投資抵減全數抵減外，產創條例之投資抵減加上廢止前促產條例投資抵減餘額未抵至應納稅額 50% ：

（ 1 ）承案例一，惟公司本年度除產創條例之投資抵減及 96 年度之廢止前促產條例投資抵減外，其餘年度已核定尚未抵減之投資抵減餘額僅再抵 130,000 元，則本年度應自繳金額為 300,000 元（ 850,000 元－ 120,000 元－ 300,000 元－ 130,000 元）。

（ 2 ）則該公司依所得基本稅額條例之規定，一般所得稅額為 300,000 元， 基本稅額 為 300,000 元【（ 5,000,000 元－ 2,000,000 元）× 10% 】，則一般所得稅額與基本所得稅額之差額 0 元，無須再繳納稅款。

（ 3 ）總計公司本年度自繳稅款為 300,000 元。而已核定可供以後年度使用之尚未抵減之廢止前促產條例投資抵減餘額為 470,000 元（ 900,000 元－ 300,000 元－ 130,000 元）。以後年度可使用之虧損扣除數為 8,000,000 元。

3. 選擇適用虧損扣抵：

（ 1 ） 100 年度經核定所得額為 5,000,000 元， 92 年度 至 99 年度核定所得額各為虧損 1,000,000 元，本年度使用以前年度核定虧損扣除額 5,000,000 元，本年度課稅所得額為 0 元，應納稅額為 0 元。

（ 2 ）則該公司依所得基本稅額條例之規定，一般所得稅額為 0 元， 基本稅額 為 0 元【（ 0 元－ 2,000,000 元）× 10% 】，則一般所得稅額與基本稅額 之差額 0 元，無須再繳納稅款。

（ 3 ）總計公司本年度自繳稅款為 0 元。未使用完之產創條例之投資抵減餘額 120,000 元及 96 年度之廢止前促產條例投資抵減餘額 300,000 元則無法於以後年度再使用，而已核定可供以後年度使用之尚未抵減之廢止前促產條例投資抵減餘額為 600,000 元（ 97 年度 300,000 元＋ 98 年度 300,000 元）。以後年度可使用之虧損扣除數為 3,000,000 元（ 8,000,000 元－ 5,000,000 元）。

4. 選擇適用投資抵減及虧損扣抵：

（ 1 ）若公司本年度使用以前年度核定虧損扣除額 2,000,000 元，則本年度應納稅額為 510,000 元（ 3,000,000 元× 17% ），因產創條例之投資抵減僅能抵 減 當年度應納稅額 ，故公司先抵產創條例之投資抵減 120,000 元（未超過應納稅額 30% ），又因 96 年度之廢止前促產條例投資抵減於本年度為最後一年，公司再抵 96 年度之投資抵減 300,000 元。扣除產創條例之投資抵減及 96 年度之廢止前促產條例投資抵減，則本年度應自繳金額為 90,000 元（ 510,000 元－ 120,000 元－ 300,000 元）。

（ 2 ）該公司依所得基本稅額條例之規定，一般所得稅額為 90,000 元（ 510,000 元－ 120,000 元－ 300,000 元）， 基本稅額 為 100,000 元【（ 3,000,000 元－ 2,000,000 元）× 10% 】，亦即公司至少本年度自繳稅款最低為 100,000 元，故公司尚應繳納一般所得稅額與 基本稅額 之差額 10,000 元（ 100,000 元－ 90,000 元）

（ 3 ）總計公司本年度自繳稅款為 100,000 元。而已核定可供以後年度使用之尚未抵減之廢止前促產條例投資抵減餘額為 600,000 元（ 97 年度 300,000 元＋ 98 年度 300,000 元），以後年度可使用之虧損扣除數為 6,000,000 元（ 8,000,000 元－ 2,000,000 元）。

5. 選擇適用投資抵減及虧損扣抵，使本年度無繳納稅款：

（ 1 ）若公司本年度使用以前年度核定虧損扣除額 3,000,000 元，則本年度應納稅額為 340,000 元（ 2,000,000 元× 17% ），扣除產創條例之投資抵減 102,000 元（應納稅額 340,000 元× 30% ）及 96 年度之廢止前促產條例投資抵減 238,000 元，則本年度應自繳金額為 0 元（ 340,000 元－ 102,000 元－ 238,000 元＝ 0 ）。

（ 2 ）該公司依所得基本稅額條例之規定，一般所得稅額 0 元，基本所得稅額為 0 元【（ 2,000,000 元－ 2,000,000 元）× 10% 】，則一般所得稅額與基本稅額 之差額 0 元，無須再繳納稅款。

（ 3 ）總計公司本年度自繳稅款為 0 元。未使用完之產創條例之投資抵減餘額 18,000 元及 96 年度之廢止前促產條例投資抵減餘額 62,000 元則無法於以後年度再使用，而可供以後年度使用之已核定尚未抵減之廢止前促產條例投資抵減餘額為 600,000 元（ 97 年度 300,000 元＋ 98 年度 300,000 元），以後年度可使用之虧損扣除數為 5,000,000 元（ 8,000,000 元－ 3,000,000 元）。