公司組織之營利事業適用所得稅法第39條規定，自本年度純益額中扣除前10年內各期核定虧損，應將各該期依同法第42條規定免計入所得額之投資收益，先行抵減各該期之核定虧損後，再以虧損之餘額，自本年度純益額中扣除。
舉例甲公司100年度營利事業所得稅列報前10年虧損扣除金額2千餘萬元，係屬98年度申報虧損數，惟經本局查得甲公司98年度核定虧損金額為2千餘萬元、當年度取得所得稅法第42條之投資收益3百餘萬元，故其前10年虧損扣除額僅有1千7百餘萬元可供扣除
該局進一步說明，按所得稅法第42條之立法意旨，在於避免轉投資收益重複課稅，但投資收益仍屬營利事業之所得，因獲實質免稅之優惠，已不計入當年度所得課稅，如於嗣後年度計算前10年度核定虧損可扣除金額時，未將該投資收益加回，則可扣除虧損金額勢將虛增，並造成投資收益取得年度與虧損扣除年度雙重獲益之情形，有違課稅公平原則，故公司於計算營利事業以往年度之虧損時，自應在核定虧損項下將免稅之投資收益減除，再以其餘額作為扣除之金額，始符課稅公平原則。 |
