財政部臺北市國稅局表示，所得稅法第39條及第75條第2項規定以往年度營業之虧損，不得列入本年度計算。但公司組織之營利事業，會計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用藍色申報書或經會計師查核簽證，並如期申報者，得將經該管稽徵機關核定之前5年內各期虧損，自本年純益額中扣除後，再行核課。另營利事業在清算期間之清算所得，應於清算結束之日起30內，依規定格式書表向該管稽徵機關申報。又財政部73年7月5日台財稅第55300號函釋規定，公司辦理清算，依所得稅法第75條第2項規定，其申報清算所得之時限，應以實際辦理清算完結之日為準起算，惟清算人如未於就任之日起6個月內清算完結，亦未報經法院核准展期者，應以6個月期間屆滿之日為準起算。
 該局指出，甲公司94年度營利事業所得稅清算申報，列報前5年核定虧損額1百餘萬元。該局以該公司逾期清算申報，否准認列「依法扣除之前5年核定虧損額」。該公司主張自94年4月1日清算人就任之日起，至94年11月1日清算人清算職務執行完畢，清算期間雖已逾6個月，但在清算人未將職務執行完畢以前，無論是否申請法院展期，似難謂清算已完結，且清算期間之清算所得，已於94年11月16日在清算結束之日（94年11月1日）起30日之內申報，並未逾期，請准予核認扣除前5年核定虧損額。經該局審查結果，因該公司清算人未於就任之日起6個月內清算完結，亦未報經法院核准展期，依財政部函釋規定，其申報清算所得之時限，應以6個月期間屆滿之日為準起算，即94年9月30日起算，辦理清算申報截止日為同年10月30日，該公司遲至94年11月16日始辦理清算申報，因已逾期，該局否准扣除前5年核定虧損額，並無不合。
 該局特別強調，公司在清算期間之清算所得，應於清算結束之日起30日內申報，而其申報清算所得之起算日，應以實際辦理清算完結之日為準起算；惟清算人如未於就任之日起6個月內清算完結，應報經法院核准展期始能延期申報。